"Düzenlenmekte olan yarışmanın amacı, ülkemizde görüntü işleme alanında çalışan araştırma gruplarının kullanmakta oldukları yöntemleri aynı probleme (karaciğer bölütleme) uygulamaları sonucu başarımlarını ölçmektir. Birçok tıbbi uygulamada hassas analiz edilmesi gereken karaciğerin en iyi şekilde bölütlenmesi ile elde edilecek çıktıların nicel ve nitel olarak değerlendirilmeleri ışığında hem tekil başarımlarının ölçülmesi, hem de yöntemlerin birbirlerini tamamlama potansiyellerinin incelenmesidir."
Karaciğer nakli öncesinde verici karaciğeri üzerinde yapılan ölçüm ve incelemeler operasyon planlaması açısından önemlidir. Karaciğerin anatomik yapısı opak madde verilerek gerçekleştirilen Bilgisayarlı Tomografi (BT) ile etkin biçimde belirlenebilmektedir. Bu sayısal çoklu imge serisi, çeşitli görüntüleme teknikleri kullanılarak 3-Boyutlu (3B) temsillerin oluşturulmasında, hacim ve damar yapısı belirlenmesinde kullanılabilir. Bu incelemelerin gerçekleştirilebilmesi için öncelikle, karaciğere ait piksellerin/voksellerin sayısal veri içerisinde belirlenmesi ve diğer verilerden ayrılması (bölütleme) gereklidir.
Veri dilimlerinden karaciğerin elcil yöntemler ile bölütlenmesi yorucu, zaman alıcı ve tecrübe gerektiren bir işlem olduğundan, (yarı) otomatik bölütleme yordamlarına ihtiyaç duyulmaktadır. Ancak birçok etmenden dolayı karaciğerin otomatik olarak bölütlenmesi çok zordur. Örneğin, her kesitte karaciğerin büyüklüğü, şekli ve karaciğeri çevreleyen organlar değişmektedir. Ayrıca çekim sırasında damarlara verilen opak maddenin farklı organların farklı derecelerde parlaklaşmasına sebep olması, karaciğere komşu organların Hounsfield değerlerinin karaciğere çok yakın olabilmesi ve karaciğerin farklı kişilerde çok farklı şekillere sahip olması gibi nedenler bölütlemeyi zorlaştıran gerekçelerdendir. Batın bölgesinin karmaşık anatomik sistemi de göz önüne alındığında, karaciğerin 3B görüntülenmesi için uyarlamalı ve gürbüz bölütleme yordamlarına ihtiyaç duyulmaktadır.
https://eee.deu.edu.tr/moodle/mod/page/view.php?id=7877
https://eee.deu.edu.tr/moodle/mod/page/view.php?id=7879
Prof. Dr. Oğuz DİCLE: DEÜ, Radyodiagnostik AD, SBE Tıp Bilişimi AD, Tıp Bilişimi Derneği (TURKMIA) Yönetim Kurulu (YK) Üyesi
Doç.Dr. Yeşim AYDIN SON: ODTÜ, Enformatik Enstitüsü, TURKMIA YK Üyesi
Prof. Dr. Gözde ÜNAL: İTÜ, Bilgisayar Müh.
Doç. Dr. Adil ALPKOÇAK: DEÜ, Bilgisayar Müh., TURKMIA YK Üyesi
Doç. Dr. M. Alper SELVER: DEÜ, Elektrik ve Elektronik Müh.
Teknik Sorumlu: A. Emre KAVUR emrekavur@gmail.com, 0 232 301 76 88
Organizasyon: A. Emre KAVUR & Dokuz Eylül Teknoloji Transfer Ofisi adına PhDc.Sevay İpek Aydın
Yarışmaya katılacak yöntemlerin özgünlüğü hususunda herhangi bir kısıt bulunmamaktadır. İlk kez önerilen bir yaklaşım kullanılabileceği gibi, literatürde karaciğer bölütleme problemine uygulanmış bir algoritmanın ya da başka bir problemin çözümünde kullanılmış bir yöntemin yarışma verisi için uyarlanması gibi önceki çalışmalara dayanan yaklaşımların (uygun referansların verilmesi koşuluyla) katılımı da uygundur. Yöntemler 2B ya da 3B çalışabileceği gibi, otomatik ya da etkileşimli (yarı-otomatik) olarak da kullanılabilir.
Yarışma tek gün içerisinde yapılacağından işlenecek 12 DICOM serisinin 10:00-16:00 arasındaki 6 saatlik sürede bölütlenmesi beklenmektedir (9:00-10:00 saatleri arası açılış ve hazırlıklar için ayrılmıştır). Bu nedenle yarışmacılar veri kümesindeki başarımları ile beraber uygulama sürelerine de dikkat etmelidirler. Yarışmacılar ekip olarak da katılım sağlayabilir ve hesapsal araçların kullanımında (Bilgisayar sayısı, uzaktan erişim vb.) sınırlama yoktur.
Değerlendirme metrikleri ve sonuç teslim formatına internet sitesinden erişebilirsiniz:
https://eee.deu.edu.tr/moodle/mod/page/view.php?id=7878
Katılımcıların kodlarını paylaşmaları mecburi değildir ancak sonuçların yeniden üretilebilirliği açısından kodların açık olması teşvik edilmektedir ve paylaşılan paketler yarışmanın internet sitesinde yayınlanacaktır.
Ekip üye sayısında sınır yoktur.
İdeal sayının farklı disiplinlerden 4 kişi olduğunu belirtmek isteriz.